在SNCR中，氨水的喷入位置的选择不仅受温度的影响，而且还会受氨水分布的影响，分布不均会导致氨气逸出量增加。氨气逸出量的测量可以通过在出口烟道安装一个能够连续测量氨的装置实现。 

氨水喷入系统必须能将氨水喷人到锅炉内最有效的部位，因为受燃烧工况的影响，NOx的分布在炉膛对流断面上是经常变化的，如果喷人控制点太少或喷到锅炉中整个断面上的氨不均匀，则一定会出现分布率较差和较高的氨逸出量。在较大的燃煤锅炉中，氨水的分布则更困难，因为较长的喷入距离需要覆盖相当大的炉内截面。多层投料同单层投料一样在每个喷入的水平切面上通常都要遵循锅炉负荷改变引起温度变化的原则。

然而，由于这些喷入量和区域是非常复杂的，因此要做到很好的调节也是很困难的。为保证脱硝反应能充分地进行，以最少的喷入氨水量达到最好的还原效果，必须设法使喷入的NH3与烟气良好地混合。若喷入的氨水不充分反应，则泄漏的氨水不仅会使烟气中的飞灰容易沉积在锅炉尾部的受热面上，而且烟气中氨水遇到SO3会生成（NH4）2SO4，易造成空气预热器堵塞，并有腐蚀的危险。